Diplômée d’un Master II recherche en Études Théâtrales à Paris III et de la section mise en scène du CNSAD en 2014, Margaux Eskenazi a travaillé trois ans au Théâtre du Rond-Point au comité de lecture. Elle y a très vite développé une activité de collaboratrice artistique avec Eric Didry, Nicolas Bouchaud, Jean-Claude Grumberg, Vincent Goethals, Xavier Gallais, Cécile Backès, le Birgit Ensemble et Clément Poirée. Depuis 2019, elle conçoit également des dramaturgies de films documentaires pour France Ô.
Son activité de metteuse en scène débute en 2007 – année où elle fonde la Compagnie Nova. Elle a monté Quartett d’Heiner Müller, Hernani de Victor Hugo et Richard III d’après William Shakespeare. Depuis 2016, elle développe un triptyque "Ecrire en pays dominé" consacré aux amnésies coloniales et aux poétiques de la décolonisation : Nous sommes de ceux qui disent non à l’ombre, Et le cœur fume encore, 1983. Pour chaque spectacle de ce triptyque, des formes en itinérance en lien avec les formes en salle sont créées : Césaire-Variations, Kateb-Variations et Après Babel.
Au printemps 2021, Margaux Eskenazi crée Gilles ou qu'est-ce qu'un samouraï, à partir de la conférence de Gilles Deleuze, Qu'est-ce que l'acte de création ?
Son travail est fortement implanté en Seine-Saint-Denis où elle met en place depuis 2007 de nombreuses actions sur le territoire en lien avec ses créations (interventions en maison d’arrêt, en milieu scolaire, en centre sociaux….). Elle intervient également dans les Ecoles Supérieures d’Art Dramatique pour mener des ateliers auprès des élèves : l’École de la Comédie de Saint-Etienne, l’Esad à Paris, l’Ecole du Nord à Lille.
Pour la saison 2023-2024, Margaux Eskenazi est en tournée de 1983, Et le coeur fume encore, de Gilles ou qu'est-ce qu'un samouraï ? Elle est en création de Si Vénus avait su pour janvier 2024 au Théâtre de la Poudrerie à Sevran plus en tournée en France et également de Kaddish-mémoires à Nanterre-Amandiers avec les élèves de la Belle Troupe en juin 2024.
Elle est artiste associée aux Gémeaux, scène nationale de Sceaux, au théâtre Jean Vilar de Vitry, au théâtre du Fil de l’Eau à Pantin et au CDN de Sartrouville.